Avec eZ Publish 5, le mot de passe de la base de données est stocké à deux endroits : dans eZ et dans Symfony.
Si tout fonctionne correctement dans le back-office, excepté l'arbre des contenus qui n'apparait pas, c'est probablement que les deux mots de passes sont différents.
Pour vérifier qu'ils sont bien configurés, vérifier dans ces deux fichiers :
ezpublish_legacy/override/site.ini.append.phpezpublish/config/ezpublish.yml
S'il y a d'autres problèmes dans le back-office, comme l'impossibilité de naviguer dans les contenus via les éléments enfants, c'est sans doute un problème de cache.